La détection de la carie du blé
Tests de détection de la carie
La détection à l’œil de la carie, que ce soit dans une parcelle (observation des épis) ou au niveau de semences (présence de grains boutés), est très difficile et aléatoire, surtout en cas de faible contamination. Il convient d’être très attentif pour éviter de propager la carie, au risque de se retrouver avec des niveaux bien plus élevés l’année suivante et de contaminer ses sols. Une analyse en laboratoire agréé est le moyen le plus sûr pour détecter la présence de carie.
Les détections de spores de caries sont réalisés par des laboratoires en phytopathologie sur demande de semenciers ou d’agriculteurs. Ces tests sont obligatoires pour les semenciers et fortement recommandés pour les agriculteurs utilisant des semences fermières. Un échantillon d'une 50aine de grammes (environs 1000 grains) est nécessaire pour l'analyse. Lorsque vous prenez votre échantillon, multipliez les points de prélèvement dans le silo pour être le plus représentatif possible.
Par exemple, une telle analyse peut être réalisée par la Station Nationale d’Essais de Semences (SNES; https://www.geves.fr/analyses/) moyennant un budget d'environs 85€.
Les différents types de tests
Le test officiel de détection est un test de filtration, identification des espèces de carie et dénombrement des spores. Il détecte la présence de spores sur les grains et les quantifie. Cependant, ce test ne permet pas de différencier les spores viables de celles qui ne le sont pas.
Ceci nécessite une étape supplémentaire au test de filtration, qui mesure la viablité des spores par une méthode de coloration. Le prix de ce test (filtration + mesure de viabilité) est d’une centaine d’euros.
Un test de détection précoce a été mis au point au GEVES dans le cadre du projet ABBLE (2015-2018). Il est opérationnel pour vérifier l’infection de plantes à partir du stade 3 feuilles. Ce test se réalise plante à plante, sur une portion de la plante. Dans le cadre de l’évaluation variétale, il facilitera l'identification des variétés résistantes à la carie. Le programme Carie ABBLE va permettre la proposition d’un protocole CTPS (Comité Technique Permanent de la Sélection des plantes cultivées) de test de résistance à la carie commune pour les variétés déposées pour l'inscription en Agriculture Biologique, permettant ainsi d'identifier des variétés résistantes à la carie. Cependant, ce test ne peut actuellement être réalisé sur un “bulk”, c’est à dire sur un échantillon de plusieurs plantes, par exemple issues d’une parcelle de production.
Test simple pour estimer la présence de grains cariés dans la récolte : le test « du seau »
Mettre 5 kg de grains dans un seau rempli d’eau. Brasser et récupérer les grains qui surnagent. Répéter ce brassage jusqu’à ce qu’aucun grain ne remonte à la surface. Observer ensuite un par un les grains surnageant récupérés et déterminer s’ils sont cariés ou non (grains bombés remplis de poussière noire).
Attention, cette technique permet de détecter grossièrement des grains cariés, mais pas une contamination exogène (résidus de spores issus d’un silo mal nettoyé, de la moissonneuse batteuse, etc). En cas de production de semences (fermières ou certifiées), elle ne se substitue en aucun cas à une analyse en laboratoire.
